MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Nanoarchaeum equitans Kin4-M chromosome

Total Repeats: 1071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005213	T	6	6	14	19	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005213	TCTT	2	8	91	98	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_005213	TA	4	8	145	152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005213	ATTCTT	2	12	170	181	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_005213	CTT	2	6	222	227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_005213	TTC	2	6	239	244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_005213	ATT	2	6	253	258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005213	TCCA	2	8	363	370	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_005213	TTC	2	6	403	408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_005213	CTTT	2	8	420	427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_005213	T	6	6	425	430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005213	TTC	2	6	451	456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_005213	T	7	7	571	577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005213	TTA	2	6	612	617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005213	TTTTA	2	10	628	637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005213	ATA	2	6	685	690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005213	TAT	2	6	703	708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005213	T	7	7	712	718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005213	TAAAAT	2	12	729	740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005213	TCTT	2	8	746	753	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_005213	T	6	6	782	787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005213	AT	3	6	789	794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005213	T	6	6	832	837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005213	TAA	2	6	3198	3203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005213	A	6	6	3202	3207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005213	AT	3	6	3224	3229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005213	GCG	2	6	3236	3241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_005213	G	6	6	3246	3251	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005213	TTC	2	6	5638	5643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_005213	TATT	2	8	5673	5680	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005213	TTTC	2	8	5681	5688	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_005213	CGG	2	6	7007	7012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_005213	CAA	2	6	7089	7094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_005213	A	6	6	8759	8764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005213	CATT	2	8	10835	10842	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_005213	TC	3	6	10887	10892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_005213	CT	3	6	10933	10938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_005213	TAAAG	2	10	10960	10969	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005213	TAA	2	6	10992	10997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005213	TAGT	2	8	11000	11007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005213	AAT	2	6	11031	11036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005213	AT	3	6	11996	12001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005213	ATTT	2	8	12010	12017	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005213	TAT	2	6	13125	13130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005213	AAT	2	6	13133	13138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005213	A	6	6	13140	13145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005213	GTA	2	6	13203	13208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005213	AAAG	2	8	13253	13260	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005213	ATTT	2	8	13266	13273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005213	TGGT	2	8	13297	13304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005213	TA	4	8	13356	13363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005213	TTTC	2	8	13369	13376	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_005213	TAA	2	6	13525	13530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005213	CAA	2	6	13682	13687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_005213	GAA	3	9	13696	13704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005213	AT	3	6	13734	13739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005213	TAT	4	12	13769	13780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005213	AT	3	6	13802	13807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005213	CTT	2	6	13814	13819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_005213	CT	3	6	13851	13856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_005213	AT	3	6	13870	13875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005213	AT	3	6	13938	13943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005213	CAG	2	6	13955	13960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_005213	ATG	2	6	13978	13983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005213	CCTT	2	8	13984	13991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_005213	AT	3	6	14004	14009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005213	TAG	2	6	14034	14039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005213	AGA	2	6	14048	14053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005213	AT	3	6	14071	14076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005213	A	6	6	14089	14094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005213	TCCG	2	8	14112	14119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_005213	AT	3	6	14139	14144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005213	TTTC	2	8	14189	14196	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_005213	AT	3	6	14207	14212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005213	CTT	2	6	14225	14230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_005213	TTA	2	6	14240	14245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005213	TG	3	6	14254	14259	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005213	AT	3	6	14275	14280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005213	TAA	2	6	14313	14318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005213	CTA	2	6	14328	14333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_005213	TCC	2	6	14336	14341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_005213	AT	3	6	14369	14374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005213	TGT	2	6	14382	14387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005213	GT	3	6	14386	14391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005213	TA	3	6	14399	14404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005213	AT	3	6	14405	14410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005213	TGT	2	6	14413	14418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005213	AT	3	6	14437	14442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005213	AT	3	6	14505	14510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005213	AT	3	6	14573	14578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005213	TTA	2	6	14633	14638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005213	ATA	2	6	14760	14765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005213	AAT	2	6	14814	14819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005213	TTA	2	6	14841	14846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005213	ATT	2	6	14856	14861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005213	TTA	2	6	16166	16171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005213	GTTT	2	8	16214	16221	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005213	TAA	2	6	16258	16263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005213	TAA	2	6	22084	22089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005213	AT	3	6	22120	22125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005213	TA	3	6	22182	22187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005213	TTG	2	6	22220	22225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005213	ATA	2	6	22256	22261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005213	ATT	2	6	23205	23210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005213	T	6	6	24317	24322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005213	AAATA	2	10	25119	25128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005213	TAG	2	6	25156	25161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005213	TTA	2	6	25174	25179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005213	AAATA	2	10	27529	27538	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005213	A	6	6	27538	27543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005213	TA	3	6	28709	28714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005213	TAT	2	6	29245	29250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005213	G	7	7	29276	29282	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005213	TATAT	2	10	29350	29359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005213	ACC	2	6	29382	29387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_005213	T	6	6	33012	33017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005213	ATT	2	6	34428	34433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005213	TAT	2	6	34736	34741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005213	TAC	2	6	35244	35249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_005213	G	6	6	35276	35281	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005213	GCC	2	6	35296	35301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_005213	T	7	7	35302	35308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005213	CCG	2	6	35323	35328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_005213	GCG	2	6	35361	35366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_005213	T	6	6	35420	35425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005213	AGT	2	6	35436	35441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005213	TTAG	2	8	39300	39307	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005213	TAA	2	6	45776	45781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005213	TGA	2	6	45782	45787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005213	AAT	2	6	45803	45808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005213	GAC	2	6	45812	45817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_005213	AGA	2	6	46935	46940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005213	TCA	2	6	46942	46947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_005213	ATTA	2	8	48326	48333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005213	A	6	6	48335	48340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005213	TATTG	2	10	48343	48352	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005213	GAT	2	6	48353	48358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005213	T	6	6	48364	48369	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005213	AGAAA	2	10	48391	48400	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005213	TC	3	6	54054	54059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_005213	TCA	2	6	54074	54079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_005213	CCG	2	6	54085	54090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_005213	GCC	2	6	54744	54749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_005213	C	6	6	54805	54810	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
145	NC_005213	GGC	2	6	54811	54816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_005213	TAA	2	6	54829	54834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005213	TAA	2	6	54886	54891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005213	AG	3	6	54897	54902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005213	TAA	2	6	54929	54934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005213	CTTTAG	2	12	54944	54955	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_005213	AT	4	8	54968	54975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_005213	TAC	2	6	55007	55012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_005213	TAT	2	6	55073	55078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_005213	CAA	2	6	55127	55132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_005213	GTTTTT	2	12	55145	55156	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_005213	AT	3	6	55171	55176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_005213	ACT	2	6	55200	55205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_005213	AAACT	2	10	55219	55228	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_005213	CGC	2	6	55235	55240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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162	NC_005213	AAT	2	6	55260	55265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_005213	CAT	2	6	55295	55300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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165	NC_005213	T	6	6	55321	55326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_005213	T	6	6	55475	55480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_005213	ACCAA	2	10	55530	55539	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
173	NC_005213	TAAA	2	8	55595	55602	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_005213	TAT	2	6	55621	55626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_005213	CTTC	2	8	55647	55654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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177	NC_005213	AT	4	8	55712	55719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_005213	TAA	2	6	55763	55768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_005213	ATAA	2	8	55796	55803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_005213	ATTT	2	8	60345	60352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_005213	TAA	2	6	64167	64172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_005213	AAT	2	6	64185	64190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_005213	CAT	2	6	66795	66800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
197	NC_005213	AT	3	6	66799	66804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_005213	T	6	6	133798	133803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_005213	TAC	2	6	135253	135258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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290	NC_005213	GTTA	2	8	145936	145943	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
291	NC_005213	TTC	3	9	145978	145986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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295	NC_005213	AGT	2	6	146663	146668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_005213	CCG	2	6	259260	259265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
441	NC_005213	GCG	2	6	259273	259278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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443	NC_005213	AT	3	6	259341	259346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_005213	ATTAC	2	10	259623	259632	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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455	NC_005213	TAT	2	6	259739	259744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_005213	AAT	2	6	260083	260088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_005213	T	6	6	260097	260102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_005213	T	6	6	260368	260373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_005213	TAT	2	6	260391	260396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_005213	CAA	2	6	260424	260429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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467	NC_005213	ATT	2	6	260454	260459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_005213	ATT	2	6	260503	260508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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482	NC_005213	A	6	6	269138	269143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_005213	A	6	6	272246	272251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_005213	TTA	2	6	272262	272267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_005213	AT	3	6	272309	272314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_005213	TAT	2	6	277198	277203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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